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“納米衛(wèi)星”能探索RNA折疊

時(shí)間:2023-03-02 11:48:59 來(lái)源:中國(guó)網(wǎng) 閱讀量:15478

RNA分子可以折疊成復(fù)雜的分子機(jī)器。受天然RNA機(jī)器的啟發(fā),丹麥奧爾胡斯大學(xué)研究人員開(kāi)發(fā)了一種名為“RNA折紙”的方法,這使得人工設(shè)計(jì)出從單一RNA支架折疊而來(lái)的納米結(jié)構(gòu)成為可能。

發(fā)表在新一期《自然·納米技術(shù)》上的這篇研究論文描述了如何使用RNA折紙技術(shù)來(lái)設(shè)計(jì)RNA納米結(jié)構(gòu),這些結(jié)構(gòu)由丹麥低溫電子顯微鏡表征。利用Cryo-EM,研究人員能微調(diào)分子設(shè)計(jì),構(gòu)建越來(lái)越復(fù)雜的納米結(jié)構(gòu)。

一個(gè)RNA圓柱體樣本包含兩個(gè)非常不同的形狀,通過(guò)在不同的時(shí)間凍結(jié)樣本,這兩個(gè)形狀之間會(huì)明顯發(fā)生轉(zhuǎn)變。研究人員實(shí)時(shí)觀察到這種轉(zhuǎn)變,并發(fā)現(xiàn)折疊轉(zhuǎn)變發(fā)生在大約10小時(shí)后。研究人員發(fā)現(xiàn)了一種所謂的“折疊陷阱”現(xiàn)象,即RNA在轉(zhuǎn)錄過(guò)程中被捕獲,然后才被釋放。

研究人員表示,折疊通常在不到一秒的時(shí)間內(nèi)完成,RNA分子折疊的速度如此之慢令人驚訝。他們希望能夠利用類(lèi)似機(jī)制,在恰當(dāng)?shù)臅r(shí)間和地點(diǎn)為患者實(shí)施RNA療法。

團(tuán)隊(duì)在哈勃空間望遠(yuǎn)鏡的啟發(fā)下,將RNA矩形和圓柱體結(jié)合在一起,創(chuàng)造了一個(gè)多域的“納米衛(wèi)星”,利用它可以探索RNA的折疊空間,并通過(guò)電子斷層掃描技術(shù)確定了單個(gè)粒子的3D結(jié)構(gòu)。

這種對(duì)RNA起源的研究,有助于改進(jìn)用于醫(yī)學(xué)和合成生物學(xué)的RNA分子的設(shè)計(jì),未來(lái),來(lái)自計(jì)算機(jī)科學(xué)、化學(xué)、分子生物學(xué)和微生物學(xué)的科研人員將能以更高的時(shí)間分辨率設(shè)計(jì)、模擬和測(cè)量折疊。



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